Мини-футбол в Кубанском ГАУ появился в 2005 году, когда сборная университета выехала на соревнования ЮФО Всероссийской Универсиады в село Архипо-Осиповка Краснодарского края. Победив всех соперников и выиграв в финале по пенальти у Кубанского университета физической культуры и спорта, ребята впервые стали чемпионами Южного Федерального округа Всероссийской универсиады. В этом турнире участвовали ВУЗы из Астрахани, Махачкалы, Новороссийска, Краснодара и других городов. Через год в Ставрополе студенты КубГАУ повторили свой успех, выиграв во всех 5 встречах и завоевав почетный кубок во второй раз подряд.
С 2008 года в программу Универсиады Кубани вместо футбола ввели мини-футбол. За это время команда Кубанского ГАУ неизменно становилась призером этих соревнований, а в 2015 и 2016 годах - чемпионом Универсиады Кубани. Так же каждый год ребята участвовали в Фестивале города Краснодара, в 2010,2011,2013,2014 годах - становились его победителями.
Сборная команда Кубанского ГАУ регулярно участвовала в соревнованиях по мини-футболу в рамках зимних Универсиад среди ВУЗов Министерства сельского хозяйства Российской Федерации. Начиная с 2006 года, Кубанский государственный аграрный университет единственный участвовал во всех финалах этого престижного для аграрных ВУЗов турнира, выиграв в 2007, 2009, 2011, 2013, 2015, 2017 и 2019 г. Первенство ЮФО/СКФО Минсельхоза России. В 2017 году на финальном этапе Универсиады команда заняла почетное III место.
В 2018 г. в пос. Сукко проходил финал АССК России по мини-футболу, участниками которого стали 32 Вуза со всей России в том числе и сборная команда Кубанского ГАУ. Ребята принесли безоговорочную победу нашему университету.
В 2019 году наша команда в очередной раз сразилась за звание чемпиона соревнований по мини-футболу в рамках IX зимней Универсиады среди ВУЗов Министерства сельского хозяйства Российской Федерации. В упорной борьбе ребята одержали желанную победу, а игрок нашей сборной Юрий Панов стал лучшим в номинации «Лучший вратарь».
С 2000 по 2008 гг. сборная КубГАУ по мини-футболу так же участвовала в различных турнирах ЮФО, края и города. На соревнованиях в рамках Универсиады среди ВУЗов Кубани ребята занимали следующие места:
